대한예수교장로회 총회는 산하에 기획조정위원회를 특별위원회로 신설하여 운영한다. 총회 규칙에 따른다.

21세기 교단이 지향하는 “하나님의 영광을 위하여 모든 피조물이 더불어 살아가는 지구 생명 공동체”에 기초하여 장·단기적 안목으로 정책총회, 사업노회로의 목표를 실현하며 총회 부서간 상호 업무 조정 등을 통하여 총회 운영의 효율성을 높이는 데 그 목적이 있다.