본 지침 제2조 (정의)에 부합하는 신앙유산을 제3조의 구분에 따라 사적(유물)로 지정하는 절차는 아래와 같다.
1. 총회지정 사적(유물)
  1) 지정을 희망하는 사적(유물)의 소유자 또는 관리권자가 소정의 신청서를 작성하여 소재지 관할노회 또는 소유자의 소속노회를 경유하여 노회장 명의로 총회에 신청한다.
  2) 신청이 접수되면 총회 위원회는 서류심사와 현장(실물)조사를 실시한다. 단 조사는 투명성, 객관성, 효율성, 합리성을 위해 아래와 같은 절차 과정을 갖는다.
    ① 현장(실물)조사는 사적분과장의 지시를 따라 반드시 전문위원 2명 이상 동반 조사를 원칙으로 한다.
    ② 현장(실물)조사는 별도로 정한 사항에 따른 조사 후 참여한 전문위원들이 조사보고서를 작성하고, 전문위원 전원의 심사를 거친 후 이를 사적분과장에게 제출한다.
    ③ 사적분과장은 위원회 회의 시 조사 결과를 보고하고, 위원회는 이를 기초로 사적 지정 여부를 결의한다.
  3) 총회 위원회의 결의로 총회 임원회에 지정 청원한다.
  4) 총회 임원회가 지정을 결정한다.
  5) 총회장이 본회 석상에서 인준을 받고 공포함으로 효력이 발생된다.
2. 노회지정 사적(유물)
  1) 지정을 희망하는 사적(유물)의 소유자 또는 관리권자가 소정의 신청서를 작성하여 소속 노회에 신청한다.
  2) 신청이 접수되면 노회 위원회는 서류심사와 현장(실물)조사를 실시한다.
  3) 노회 위원회의 결의로 노회 임원회에 지정 청원한다.
  4) 노회 임원회가 지정을 결정한다.
  5) 노회장이 노회(정기, 임시) 석상에서 인준을 받고 공포함으로서 효력이 발생된다.
3. 소유자 또는 관리권자의 신청이 없더라도 위원회가 조사, 심의하여 그 가치를 인정한 경우는 소유자 또는 관리권자의 동의를 얻어 신청할 수 있다.
4. 총회지정 역사 기념지(기념물)
  1) 총회는 한국교회 역사와 밀접한 관련이 있고 교류가 있는 소유자(관리권자)의 신청에 따라 다음과 같이 기념지(기념물)을 지정할 수 있다.
     ① 해외 소재
     ② 국내 개인 소유
     ③ 국내 타 교단(파) 소속
  2) 총회에 신청서와 증빙서류를 첨부하여 제출하면 총회 위원회가 심의하되, 해외의 경우는 서류 등 자료 심사로 결정한다.
  3) 지정절차는 1항과 같고 기념증서와 기념동판을 교부한다.
  4) 본 지정은 상호교류와 역사보존의 목적으로 「기념」하는 것일 뿐이므로, 총회가 어떠한 의무와 책임을 지지 않는다.

1. 임원회가 지정(등록)여부를 결정하면 위원회는 신청자에게 결정을 통지한다.
2. 총회지정 사적(유물)은 총회 공포 후 총회 기관지와 총회 홈페이지 역사사료관 게시판에 고시한다.
3. 노회지정 사적(유물)은 노회 공포 후 총회에 보고하여 총회 홈페이지 역사사료관 게시판에 고시한다.

1. 총회지정 사적(유물)은 총회 폐회 후 지정식을 통해 효력이 확정된다. 단 회기 내 지정식을 하지 못할 때는 총회에 연기 청원을 해야 한다.
  1) 지정식은 위원회가 해 노회와 협의하여 형편에 따라 시행한다.
  2) 위원회는 지정동판과 지정서를 교부한다.
    ① 지정동판에는 명칭, 지정번호, 지정식날자 등을 적시하고 규격(cm)은 30×21 또는 42×30로 한다.
    ② 지정서에는 공포문, 명칭, 지정번호, 구분, 지정식일자, 소유자 또는 관리권자, 주소(보관장소) 등을 적시하고 총회장인을 날인한다.
    ③ 지정번호는 다음과 같이 부여한다.
       ㉠ 사적 : 청원 순서대로, 한국기독교사적 제( )호
       ㉡ 유물 : 청원 순서대로, 한국기독교유물 제( )호
       ㉢ 연관성 지정은 제( )호 아래, 제( )호-일련번호
    ④ 기념지와 유물 : 한국기독교 역사 기념지(기념물) 제( )호
    ⑤ 유물 지정식은 동판 없이 지정서만 교부하고, 이미 사적 지정식을 거행한 교회 및 기관의 경우에는 협의하여 지정서 전달로 지정식을 대체할 수 있다.
2. 구분은 건물(제원), 기념지(터, 면적), 구조(설치)물 명칭(제원), 물품(제원)의 구체적 명칭과 숫자 등 가급적 상세하게 표시한다.
3. 노회지정 사적(유물)은 노회 폐회 후 소유자 또는 관리권자에게 지정서를 교부하고 그 밖의 절차와 지정식은 총회지정 기준을 참고하여 자체적으로 정한다.
  1) 지정서는 명칭, 지정번호, 지정일(노회일자), 구분, 교부일, 주소(보관장소) 등을 적시하고 노회장인을 날인한다.
  2) 지정번호는 청원 순서대로 노회명/사적(유물)/YYMM-일련번호로 부여한다.
4. 총회지정 사적(유물)이나 노회지정 사적(유물) 중 소유자 또는 관리권자가 보안상의 문제가 있어 요청할 경우, 위원회의 동의를 거쳐 총회 사료관에 임시 거치할 수 있다.

이미 노회지정 사적(유물)에 대해서 한국교회사적 가치를 인정하여 총회지정으로 승격할 수 있다.
1. 해 노회의 청원으로 총회 위원회가 결의하여 총회 임원회에 지정 청원한다.
2. 총회 위원회는 사전에 소유자(관리권자)의 동의를 얻어야 한다.
3. 절차는 제1절 지정의 총회지정 규정에 따른다. 단 이 경우 지정식은 생략할 수 있다.

지정의 가치가 상실되거나 특별한 사유가 있을 경우, 소관 위원회가 심의하여 청원하면 임원회의 결의로 그 지정이 취소되고 총회 본 회나 노회(정기, 임시)에 보고하므로 확정된다. 취소 사유가 해소된 경우는 본 절차에 준하여 해제한다.

제2조에 의하여 가치가 인정되는 사적(유물)로서 총회 본회나 노회(정기,임시)를 통해 지정의 효력이 발생되기 전에 긴급한 상황으로 지정이 필요한 경우는 위원회가 가지정을 청원할 수 있고 임원회의 결의에 따라 지정의 효력이 발생하고 반드시 총회 본회나 노회(정기, 임시)에서 추인의 절차를 밟아야 한다.

사적이 국가 혹은 시·도 지정문화재로 등시 지정된 경우, 해당 법규의 우선 지침을 받으며, 사적의 관리, 보존, 활용에 관하여 해당 단체와 협의해야 한다.

위원회는 사적(유물)에 대해서 해 노회와 소유자 또는 관리권자와 협의하여 관리 의무를 지정서에 명시한다. 관리란 보존과 활용에 대한 일체의 사항을 포함한다.
  1) 사적(유물)의 1차적 관리 책임은 소유자 또는 관리권자에게 있다. 해 위원회와 해 노회, 총회는 적극 협력한다.
  2) 사적(유물)의 상태 변경에 대해서 소유자 또는 관리권자와 해 노회는 총회 위원회에 보고할 의무가 있다. 소유자 또는 관리권자의 변경, 보관 장소나 위치의 변경, 손실 등은 즉시 보고해야 한다.
  3) 보존에 영향이 있을 경우 위원회의 동의가 있어야 보수(변경)을 시행할 수 있다.
  4) 소유자 또는 관리권자는 사적(유물)에 대한 기록, 자료수집, 연구 등에 노력하고 이를 위해 해 위원회에 협조를 요청할 수 있다.
  5) 소유자 또는 관리권자와 해 노회, 해 위원회는 사적(유물)의 보존과 활용(공개, 사용, 전시 등)을 위해 상호 적극 협력한다.

사적 지정과 관리에 필요한 예산은 총회와 노회의 지원금과 교회나 독지가의 후원금으로 충당한다.