본 재단의 모든 장학금은 “총회 장학금” 명으로 수여한다.
1. 총회 산하 자립대상교회 목회자자녀 장학금
2. 총회직영신학대학교 장학금
3. 총회유관 기독교대학교 장학금
4. 특별장학금
  1) 부서 장학금(농어촌거제 장학금, 에큐메니칼 장학금, 기독교교육 장학금)
  2)기타 장학금