① 규정 제49조의 납입 절차와 방법은 다음과 같다.
  1. 납입내용 기입
     가. 납입의무자(교회 · 기관)
     나. 회원번호
     다. 이름
     라. 납입월
     마. 납입금(소급납입금의 사유 포함)
  2. 납입 방법
     가. 연금재단에 은행자동납부 신청

규정 제50조의 규정에 의한 재정균형을 위한 수리계산은 다음 자료를 기준으로 하여야 한다.
  1. 가입 시의 평균 연령
  2. 가입자의 평균 연령
  3. 퇴직 시의 평균 연령
  4. 가입 중 사망자의 평균 연령
  5. 연금 수급자의 평균 연령
  6. 연금 수급자 중 사망 평균 연령
  7. 퇴직자의 직종별 급여 비율(인원 · 급여)
  8. 연금의 종별 평균 지급기간
  9. 가입 시의 평균 호봉과 부담 금액
  10. 가입자의 평균 호봉과 부담 금액
  11. 장애연금(인원 · 비율 · 연금액)
  12. 휴직연금(인원 · 비율 · 연금액)
  13. 기금 운용이율(연도별 · 월별)
  14. 가입률(목사 · 전도사)
  15. 기타 재단이 정하는 사항

연금규정 제51조 제1항의 규정에 의하여 가입자가 납부기한까지 납입금을 납부하지 아니하는 경우에 미납된 납입금에 대하여 연체료를 부과한다. 연체료 부과기준은 미납한 1개월은 면제하며 2개월과 3개월에 납부 시 3를 부과하고 4개월 부터 6개월까지는 6를 부과한다. 연체료는 납입금을 납부한 다음 달에 별도로 청구한다. 단 자동이체로 납입금을 납부하는 경우에는 납부한 다음 이체일에 출금한다.

규정 제51조 제2항의 가입자가 연간 납입금을 매년 1월 중에 전액 선납할 때에는, 납입시 최근 월의 한국은행 경제통계시스템(이하 ‘ECOS’)에 공시된 금리에 예금은행 가중평균금리의 수신금리 중 신규취급액기준 정기예금(1년)의 직전년도 3/4분기말 기준 이자율에 해당하는 금액을 할인한다.